MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC5

Total Repeats: 633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017074	GGC	2	6	34	39	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080719
2	NC_017074	ACG	3	9	49	57	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080719
3	NC_017074	AAGG	2	8	223	230	50 %	0 %	50 %	0 %	383080719
4	NC_017074	GAA	2	6	264	269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080719
5	NC_017074	GCCA	2	8	366	373	25 %	0 %	25 %	50 %	383080719
6	NC_017074	ACA	2	6	385	390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080719
7	NC_017074	ATT	2	6	418	423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080719
8	NC_017074	GCA	2	6	424	429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080719
9	NC_017074	CTG	2	6	500	505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080719
10	NC_017074	TGG	2	6	515	520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080719
11	NC_017074	CAA	2	6	602	607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080719
12	NC_017074	ATT	2	6	621	626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080719
13	NC_017074	AAG	2	6	659	664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080719
14	NC_017074	GTT	2	6	683	688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080719
15	NC_017074	CCG	2	6	707	712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080719
16	NC_017074	AAG	2	6	740	745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080719
17	NC_017074	AGG	2	6	761	766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080719
18	NC_017074	GCT	2	6	805	810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080720
19	NC_017074	GAA	2	6	824	829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080720
20	NC_017074	CTG	2	6	830	835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080720
21	NC_017074	CA	3	6	843	848	50 %	0 %	0 %	50 %	383080720
22	NC_017074	AGA	2	6	892	897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080720
23	NC_017074	AGA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080720
24	NC_017074	TCTGA	2	10	1040	1049	20 %	40 %	20 %	20 %	383080720
25	NC_017074	TTG	2	6	1098	1103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080720
26	NC_017074	GAGC	2	8	1126	1133	25 %	0 %	50 %	25 %	383080720
27	NC_017074	A	6	6	1141	1146	100 %	0 %	0 %	0 %	383080720
28	NC_017074	CTG	2	6	1163	1168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080720
29	NC_017074	GAA	2	6	1258	1263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080720
30	NC_017074	TTC	2	6	1307	1312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080720
31	NC_017074	ACA	2	6	1374	1379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080720
32	NC_017074	GTT	2	6	1396	1401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080720
33	NC_017074	A	6	6	1427	1432	100 %	0 %	0 %	0 %	383080720
34	NC_017074	T	8	8	1948	1955	0 %	100 %	0 %	0 %	383080721
35	NC_017074	ATTT	2	8	1956	1963	25 %	75 %	0 %	0 %	383080721
36	NC_017074	T	6	6	2065	2070	0 %	100 %	0 %	0 %	383080721
37	NC_017074	AT	3	6	2098	2103	50 %	50 %	0 %	0 %	383080721
38	NC_017074	TTC	2	6	2142	2147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080721
39	NC_017074	TTC	2	6	2400	2405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080721
40	NC_017074	A	7	7	2421	2427	100 %	0 %	0 %	0 %	383080721
41	NC_017074	TTTCC	2	10	2465	2474	0 %	60 %	0 %	40 %	383080721
42	NC_017074	TA	3	6	2511	2516	50 %	50 %	0 %	0 %	383080721
43	NC_017074	ATGA	2	8	2520	2527	50 %	25 %	25 %	0 %	383080721
44	NC_017074	GC	3	6	2619	2624	0 %	0 %	50 %	50 %	383080721
45	NC_017074	CTT	2	6	2679	2684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080721
46	NC_017074	TAA	2	6	2765	2770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080721
47	NC_017074	T	6	6	2771	2776	0 %	100 %	0 %	0 %	383080721
48	NC_017074	TCT	3	9	2786	2794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080721
49	NC_017074	ATA	2	6	2815	2820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080721
50	NC_017074	AC	3	6	3165	3170	50 %	0 %	0 %	50 %	383080722
51	NC_017074	GCT	2	6	3207	3212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080722
52	NC_017074	ACT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080722
53	NC_017074	AAT	2	6	3383	3388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080722
54	NC_017074	ATT	2	6	3402	3407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080722
55	NC_017074	GGA	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080722
56	NC_017074	CAA	2	6	3463	3468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080722
57	NC_017074	TAT	2	6	3941	3946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080723
58	NC_017074	GAC	2	6	3979	3984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080723
59	NC_017074	GCA	2	6	4003	4008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080723
60	NC_017074	AAGGA	2	10	4018	4027	60 %	0 %	40 %	0 %	383080723
61	NC_017074	CTG	2	6	4028	4033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080723
62	NC_017074	GGC	2	6	4049	4054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080723
63	NC_017074	CTG	2	6	4067	4072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080723
64	NC_017074	AAG	2	6	4258	4263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080724
65	NC_017074	GTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080724
66	NC_017074	GCTGT	2	10	4297	4306	0 %	40 %	40 %	20 %	383080724
67	NC_017074	TC	3	6	4341	4346	0 %	50 %	0 %	50 %	383080724
68	NC_017074	TA	3	6	4843	4848	50 %	50 %	0 %	0 %	383080725
69	NC_017074	GCC	2	6	4873	4878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080725
70	NC_017074	TA	4	8	4952	4959	50 %	50 %	0 %	0 %	383080725
71	NC_017074	AGC	2	6	5113	5118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080726
72	NC_017074	ACA	2	6	5135	5140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080726
73	NC_017074	AAG	2	6	5161	5166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080726
74	NC_017074	AGG	2	6	5243	5248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080726
75	NC_017074	AT	3	6	5250	5255	50 %	50 %	0 %	0 %	383080726
76	NC_017074	CGA	2	6	5256	5261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080726
77	NC_017074	AAG	2	6	5264	5269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080726
78	NC_017074	GAA	2	6	5328	5333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080726
79	NC_017074	TCT	2	6	5388	5393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080726
80	NC_017074	CGA	2	6	5424	5429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080726
81	NC_017074	AGC	2	6	5441	5446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080726
82	NC_017074	ACA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080727
83	NC_017074	ACG	2	6	6090	6095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080727
84	NC_017074	ACT	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080727
85	NC_017074	A	8	8	6115	6122	100 %	0 %	0 %	0 %	383080727
86	NC_017074	ACA	2	6	6196	6201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080727
87	NC_017074	CTG	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080727
88	NC_017074	TTGC	2	8	6222	6229	0 %	50 %	25 %	25 %	383080727
89	NC_017074	ATGC	2	8	6234	6241	25 %	25 %	25 %	25 %	383080727
90	NC_017074	CAA	2	6	6245	6250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080727
91	NC_017074	ACA	2	6	6253	6258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080727
92	NC_017074	AAG	2	6	6276	6281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080727
93	NC_017074	AAG	2	6	6381	6386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080727
94	NC_017074	CGT	2	6	6412	6417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080727
95	NC_017074	ACT	2	6	6499	6504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080727
96	NC_017074	GCTG	2	8	6566	6573	0 %	25 %	50 %	25 %	383080727
97	NC_017074	CA	3	6	6587	6592	50 %	0 %	0 %	50 %	383080727
98	NC_017074	GAA	2	6	6600	6605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080727
99	NC_017074	AGG	2	6	6613	6618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080727
100	NC_017074	GTT	2	6	6642	6647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080727
101	NC_017074	GAA	2	6	6651	6656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080727
102	NC_017074	GACG	2	8	6683	6690	25 %	0 %	50 %	25 %	383080727
103	NC_017074	AGC	2	6	6733	6738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080727
104	NC_017074	TTCTA	2	10	6744	6753	20 %	60 %	0 %	20 %	383080727
105	NC_017074	GC	3	6	6773	6778	0 %	0 %	50 %	50 %	383080727
106	NC_017074	ATGT	2	8	6801	6808	25 %	50 %	25 %	0 %	383080727
107	NC_017074	CGA	2	6	6935	6940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080727
108	NC_017074	TCAT	2	8	6976	6983	25 %	50 %	0 %	25 %	383080727
109	NC_017074	GGAAT	2	10	7067	7076	40 %	20 %	40 %	0 %	383080727
110	NC_017074	CAG	2	6	7083	7088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080727
111	NC_017074	TCT	2	6	7142	7147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080727
112	NC_017074	CAA	2	6	7178	7183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080727
113	NC_017074	GCT	2	6	7191	7196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080727
114	NC_017074	GAA	2	6	7335	7340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080727
115	NC_017074	AAG	2	6	7341	7346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080727
116	NC_017074	AGCA	2	8	7352	7359	50 %	0 %	25 %	25 %	383080727
117	NC_017074	ACC	2	6	7371	7376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383080727
118	NC_017074	AGCA	2	8	7382	7389	50 %	0 %	25 %	25 %	383080727
119	NC_017074	GTC	2	6	7404	7409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080727
120	NC_017074	AC	3	6	7411	7416	50 %	0 %	0 %	50 %	383080727
121	NC_017074	CAA	2	6	7471	7476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080727
122	NC_017074	TTAGCA	2	12	7540	7551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383080727
123	NC_017074	ACGG	2	8	7617	7624	25 %	0 %	50 %	25 %	383080727
124	NC_017074	CAGC	2	8	7625	7632	25 %	0 %	25 %	50 %	383080727
125	NC_017074	GTAT	2	8	7634	7641	25 %	50 %	25 %	0 %	383080727
126	NC_017074	CG	3	6	7712	7717	0 %	0 %	50 %	50 %	383080727
127	NC_017074	ACA	2	6	7901	7906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080728
128	NC_017074	ATT	2	6	7913	7918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080728
129	NC_017074	TGAA	2	8	7953	7960	50 %	25 %	25 %	0 %	383080728
130	NC_017074	GCA	2	6	7991	7996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080728
131	NC_017074	CAG	2	6	8039	8044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080728
132	NC_017074	GAAGCA	2	12	8083	8094	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383080728
133	NC_017074	AGGCCA	2	12	8106	8117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080728
134	NC_017074	A	6	6	8132	8137	100 %	0 %	0 %	0 %	383080728
135	NC_017074	CAA	2	6	8142	8147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080728
136	NC_017074	GAAC	2	8	8239	8246	50 %	0 %	25 %	25 %	383080728
137	NC_017074	AGCA	2	8	8252	8259	50 %	0 %	25 %	25 %	383080728
138	NC_017074	GCCG	2	8	8263	8270	0 %	0 %	50 %	50 %	383080728
139	NC_017074	TTA	2	6	8365	8370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080728
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141	NC_017074	CG	3	6	8475	8480	0 %	0 %	50 %	50 %	383080728
142	NC_017074	GCCG	2	8	8726	8733	0 %	0 %	50 %	50 %	383080728
143	NC_017074	CAA	2	6	8764	8769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080728
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157	NC_017074	TGC	2	6	9377	9382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080729
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161	NC_017074	CAG	2	6	9896	9901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080730
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164	NC_017074	GGCA	2	8	9994	10001	25 %	0 %	50 %	25 %	383080730
165	NC_017074	GTTGAC	2	12	10002	10013	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383080730
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167	NC_017074	CTT	2	6	10227	10232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080730
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255	NC_017074	GCA	2	6	14282	14287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080738
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262	NC_017074	GAC	2	6	14827	14832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080739
263	NC_017074	TTG	2	6	14927	14932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080739
264	NC_017074	CG	3	6	14955	14960	0 %	0 %	50 %	50 %	383080739
265	NC_017074	TGT	2	6	14988	14993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080739
266	NC_017074	GCCG	2	8	15015	15022	0 %	0 %	50 %	50 %	383080739
267	NC_017074	ACG	2	6	15023	15028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080739
268	NC_017074	GAC	2	6	15148	15153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080739
269	NC_017074	AG	3	6	15205	15210	50 %	0 %	50 %	0 %	383080739
270	NC_017074	GTTCAG	2	12	15234	15245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383080739
271	NC_017074	CCT	2	6	15279	15284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383080739
272	NC_017074	GCA	2	6	15372	15377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080739
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276	NC_017074	GACTG	2	10	15664	15673	20 %	20 %	40 %	20 %	383080739
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281	NC_017074	CCA	2	6	16012	16017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383080739
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283	NC_017074	GCA	2	6	16065	16070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080740
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285	NC_017074	ACG	2	6	16242	16247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080740
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289	NC_017074	TTGA	2	8	16466	16473	25 %	50 %	25 %	0 %	383080740
290	NC_017074	GTT	2	6	16520	16525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080740
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299	NC_017074	AAG	2	6	17060	17065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080741
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322	NC_017074	AAC	2	6	18144	18149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080742
323	NC_017074	GAC	2	6	18204	18209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080742
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352	NC_017074	ACC	2	6	19745	19750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383080746
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386	NC_017074	A	6	6	21753	21758	100 %	0 %	0 %	0 %	383080748
387	NC_017074	ACA	2	6	21890	21895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080749
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390	NC_017074	GCA	2	6	21932	21937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080749
391	NC_017074	CTGCGT	2	12	21966	21977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080750
392	NC_017074	GCA	2	6	22019	22024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080750
393	NC_017074	AGACC	2	10	22199	22208	40 %	0 %	20 %	40 %	383080750
394	NC_017074	CTGAA	2	10	22225	22234	40 %	20 %	20 %	20 %	383080750
395	NC_017074	TAC	2	6	22357	22362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080750
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404	NC_017074	GCG	3	9	22800	22808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080750
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